两者体型，羽毛颜色，叫声有区别。具体如下:
绿头鸭：中等体型（58cm），为家鸭的祖先之一，虹膜褐色，嘴黄色，脚橘黄色。雄鸟头及颈深绿色带光泽，白色颈环将头与栗色胸分隔开，叫声为轻柔的kreep声。雌鸟褐色斑驳，有深色的贯眼纹，叫声似家鸭。
绿翅鸭：体型较小（37cm），飞行速度较快，虹膜褐色，嘴和脚灰色，绿色翼镜在飞行时非常明显。雄鸟具有金属亮绿色，带皮黄色边缘的贯眼纹横贯栗色头部，肩羽上有一道长长的白色条纹，深色的尾下羽外缘具有黄色斑块，其余体羽多灰色，叫声似金属声。雌鸟褐色斑驳，腹部色浅，翼镜亮绿色，前翅色深，头部色浅，叫声为细高而短。
