材料：大豆500g、豆菌5g、高压锅、不锈钢盆、泡沫饭盒等浅容器、泡沫箱子、2立升长方形塑胶瓶子或暖水袋、温度计
1、泡豆蒸豆
将大豆充分洗净后，加入3倍量的水浸泡一夜后，倒掉水放进高压锅内蒸到大豆用手捏碎的程度，大约45分钟。如没有高压锅，煮水时一次不要放得太多。为了保持大豆的原汁原味，最好是蒸。
2、接种豆菌
将豆菌用50ml热水（温度最好38-45℃，温度太高会杀死豆菌）溶解后，均匀地加入到热大豆中（温度最好38-45℃，温度太高会杀死纳豆菌），迅速搅拌均匀，分装在7个泡沫饭盒里，厚度大约2cm，上面苫上纱布或者在饭盒与饭盒盖之间架上一双筷子，使其充分接触空气。因豆菌是嗜氧菌，接触空气是很重要的。发酵好以后，就要盖好盖，用胶带封住口，避免接触空气利于长期保存。
3、在恒温下发酵14-36小时
在干净的大泡沫箱内放入几瓶装满50℃热水的长方形塑胶瓶子，把已接种上纳豆菌的泡沫饭盒摆在瓶子上，箱内理想温度是42℃。如箱内温度降到38℃时，瓶内重新换入50℃的热水。如此反复更换瓶内热水，发酵14-36小时，大豆表面产生了白膜，有粘丝出现后，大豆就变成臭豆子了。如没有泡沫箱子，也可使用大纸盒，四周包上棉被和电褥子，或者箱内插入一只45℃的电灯泡等方法来保持箱内恒温。注意多接触空气。
4、后熟（活菌低温休眠）
在38-42℃的恒温下发酵14-36小时，然后放在冰箱内低温贮藏数小时后，做好的臭豆子无论是外观还是口感都会更好。因此建议臭豆子做好后，先放入冰箱内低温贮藏数小时以后再食用或长期保存。
5、制作关键
①注意保持38-42℃的恒温。②豆菌要接种到热热的大豆中（温度最好38-45℃，温度太高会杀死豆菌）。
6、豆菌的保存
豆菌菌种因处于孢子状态特别稳定，只要放在阴凉干燥处就能长期保存。但开封后一定要放在冰箱内低温保存。
