芽苗菜三天后长白毛后根部变黄形成原因主要由于豆层缺氧，浇水温度或培育温度不稳定导致。豆芽过期采收、胚根衰弱，使用不洁净水也易诱发此病。
其主要原因就是种子自身带菌，前期种植杀菌处理不彻底，里边含有霉菌、生长过程中种植环境杂菌多，污染了芽菜导致烂根烂芽或者是生产场地和器具消毒不彻底造成有害菌滋生大量繁殖，从而造成芽菜的生病腐烂。
说明已经开始腐烂了。应该注意的是挑除瘪籽，破烂，霉烂及发过芽的种子。
一是豆芽两头完好，中间腐烂，俗称折腰，二是豆芽成片迅速腐烂，原因是湿度太高，水分过多以及病菌污染，三是豆芽根部发黑，不长须根，芽很短，逐渐腐烂，这种现象是在温度低而湿度大的情况下容易 发生的，防止烂缸的方法除控制温度 湿度外还要注意卫生，避免豆芽受到污染。
