山柰一般贮存于阴凉干燥处，温度28℃以下，相对湿度70%~75%。安全水份在85%~13%。本品易虫蛀，受潮生霉，贮存过久变色、散味。储藏期间，保持环境干燥、凉爽，定期检查，发现吸潮或轻度生霉、虫蛀，及时晾晒通风，严重时用磷化铝熏杀。
