商借函与借调函的主要区别如下:
1、首先，两者的发布方式不一样。商借函是人事部门的商调，指的是两个部门的商洽或者协商，有正式工作单位和工作关系的人事调动，都是使用的商调（商调也是正式调动）。借调函是一种人事安排，常见于政府及公营机构。被借调的人员会由原任机构或单位（原任单位）暂时“借”到其他机构或单位（借调单位）任职，以执行指定的工作。
2、其次是薪资发放的方式不一样。商借函是通过协商的方式将同级部门或者不同地区部门的人员直接调入本单位工作的方式。而借调函则是因为临时工作需要，从下级单位抽调人员，临时支援单位业务工作的形式，在借调后，被借调人员的编制、人事关系、工资发放都仍由原单位进行管理。
3、再就是工作方式不一样。商借函是指用人单位之间因工作需要而采取借调工作人员的形式。需要借调单位和被借调单位之间签订借调合同。借调合同期满，被借调者仍回原单位工作。而借调函指人事方面的调动，即甲乙两个单位通过协商，将一方的工作人员调到另一方去工作。
