系团总支主要职责如下：
1、组织团员青年学习党的路线、方针、政策，有针对性地抓好政治理论学习、形势任务教育和基础文明建设，不断提高团员的思想政治素质，引导团员青年树立正确的世界观，人生观和价值观，充分发挥团员的模范带头作用。
2、根据系党支部和院团委、院学生处的工作部署，提出学期或年度计划，认真落实并及时总结。
3、配合系党支部做好学生的日常教育和管理工作，协助处理学生学习生活中出现的问题。
4、搞好团支部组织建设，严格团的组织生活，健全团内“三会一课”制度。
5、加强团总支自身建设，健全团的组织生活制度。
6、做好优秀团支部、优秀团员、优秀团干部等评比工作，做好团员证的管理、发展新团员、团员情况统计等工作
7、负责团内纪律监察，对本系违反团纪的团员进行批评教育和向院团委提出处分意见。
8、配合党支部做好党员发展工作，对于入党积极分子进行培养、 教育、考察，做好“推优”工作。
9、组织开展校园文化、特色活动、社会实践活动和形式多样的社团活动，丰富和活跃学生业余生活，促进健康、文明的系风和校风的形成。配合管理人员搞好公寓管理，加强公寓文化建设。
10、指导和帮助系学生社团依照各自章程，积极主动地开展工作，支持院学生会和学生社团的工作。
1、
在院团委领导和各系主任指导下，主持团总支工作，提出系共青团的总体思想，提出阶段性工作计划并组织实施，做好团总支年度总结、评比和表彰工作。
2、
负责组织学生学习马列主义、毛泽东思想、邓小平理论和"三个代表"重要思想，学习党的路线、方针、政策，开展形势教育和各种思想教育活动。
3、
负责团员的教育管理，及时掌握团员的思想动态，做好团的组织发展和推荐优秀团员入党的工作。
4、
围绕学风建设，结合教学工作，开展各种有益于学生刻苦学习、立志成才的丰富多彩的课外活动。
