细胞膜上的蛋白， 主要有受体蛋白 (如G偶连受体蛋白， TLR等)， 离子通道蛋白， 细胞连接蛋白， 细胞黏附蛋白(Integrin等)， 核膜上的蛋白(如形成核孔的蛋白符合物) 叶绿体光合作用中心的光合作用蛋白等细胞质中的蛋白细胞骨架蛋白(微丝，微管蛋白)， 各种蛋白类的酶， 各种信号通路效应蛋白， 可以在微丝，微管上运动的动力蛋白和马达蛋白等， 还有调节基因转录的转录因子， 与DNA结合的组蛋白， 与核糖体结合的核糖体蛋白，还有一些发光蛋白（如GFP）等
首先是没有细胞结构生物中的蛋白， 像病毒的衣壳蛋白， 和蛋白类病毒--朊病毒，还有就是单细胞生物如细菌等分泌的趋化因子， 蛋白类的酶等
多细胞生物体内的细胞间通讯作用的分泌型蛋白(自分泌，旁分泌，内分泌)， 细胞外基质蛋白(如胶原蛋白等) ，各种诱导因子，还有蛋白免疫系统中的抗体，补体，干扰素等，各种激素（如胰岛素，促甲状腺素等），一些特殊蛋白如蛇毒蛋白，大豆根瘤菌分泌在根瘤中运输氧气的血红蛋白等
人体内的蛋白质以游离的氨基酸形式存在，蛋白质在核糖体（RRNA）上核成，mrna穿入rrna，由trna携带的氨基酸在rrna上与mrna结合，将氨基酸互相结合，构成最初的蛋白质。
自然界中，蛋白质都是与脂肪或碳水化 合物以脂蛋白或糖蛋白的形式出现，蛋清、乳酪及瘦肉中的蛋白质，是我们所能发现最纯 的蛋白质 。
动物性的蛋白质来源包括所有的肉类、家禽及鱼类等食物。
