造成荔枝裂果的原因主要是果实发育过程中的肥水失调。对荔枝果实发育影响最大的两个元素，一个是钙、一个是钾。钙是构成果皮中果胶的有效成分，如果缺少钙，果皮细胞与细胞之间的联结能力就差了，而且细胞壁的弹性和强度变弱，如果果肉长得太快或吸水过多，果皮就会被涨破而出现裂果。
另外钙还担负着调节果实内水分平衡的重任，如果缺钙，果实中水分失调，在天旱时，果实失水，果皮容易被晒伤而停止生长，当果肉生长时，果皮就会涨裂在雨天，果实因含糖分高，会大量吸水而涨破果皮。荔枝果肉发育则需大量的钾元素，如果钾素供应不均匀，在缺钾时，果肉生长减慢甚至停止，钾多时突然生长加快，涨破果皮而裂果。
