赫拉克利特将火看作一种宏观物质形态，主张生机勃勃、往复燃烧熄灭的火是宇宙与万物的本源，万物生自火，复归于火，火是万物变化生灭的活力之源世界上的一切事物永远都在运动变化之中，万物皆流，无物常驻。
他以火为本原，将世界的多样性统一于一种变动不居、能变生各种异质事物的具体物质，从而将米利都哲学推进到一个新境界，展示了一幅较完整的朴素辩证法的世界图景。
他的主要的思想有：
永恒的活火
“这个有秩序的宇宙（科斯摩斯）对万物都是相同的，它既不是神也不是人所创造的，它过去、现在和将来永远是一团永恒的活火，按一定尺度燃烧，一定尺度熄灭。”
万物皆流
赫拉克利特有一句名言“人不能两次走进同一条河流”，这句名言的意思是说，河里的水是不断流动的，你这次踏进河，水流走了，你下次踏进河时，又流来的是新水。
逻各斯说
赫拉克利特认为万物是永远变动的，而这种变动是按照一定的尺度和规律进行的。这就是他的逻各斯学说，是他的辩证法思想的第二个方面。
对立统一
原始的统一是不断地活动和变化的，永不停止。它的创造是毁灭，毁灭是创造。一种东西变成另外一种东西，比如火变成水，火就消失在新的存在形式中。每一种东西都这样变成它的对立面，因此每一种东西都是对立性质的统一。
