蒙古国位于中俄之间的蒙古高原上，境内有河流3800条，总长度达6.7万公里，平均年径流量为390亿立方米，有3500个湖泊，7000多处泉眼，湖泊水资源量达1800亿立方米。全国99%的河流全部流向俄罗斯，南部接壤的中国除了东流黑龙江的克鲁伦河（最终还成为中俄界河），西部几条小支流汇入额尔齐斯河（最终还是流入俄罗斯），其余再无河流流向中国。
主要河流有色楞格河、鄂尔浑河、克鲁伦河和科布多河等50多条大河，大部分分布在北部、中部地区。湖泊大多分布在西北地区，主要湖泊有乌布苏湖、库苏古尔湖、吉尔吉斯湖和哈拉乌苏湖。南部则河流、湖泊很少。
色楞格河源于蒙古杭爱山北坡，称为伊德尔河，流经蒙古北部，注入俄罗斯贝加尔湖，是叶尼塞河—安加拉河的源头之一。全长1024千米，流域面积945480平方千米。哈努依河和鄂尔浑河从右岸注入，德勒格尔河和额吉河从左岸注入。水流湍急，河床落差为720米。自河口可通航到苏赫巴托市。10-11月开始结冰，次年4-5月解冻。流经蒙古重要的农牧经济地区。该河流向东北，与鄂尔浑河汇合于苏赫巴托尔，继续北流，进入俄国境内转向东，到达布里亚特首府乌兰乌德。河水从此处向北流到塔陶罗沃，再向西弯转，流经一片三角洲，注入贝加尔湖。
鄂尔浑河蒙古北部河流，色楞格河最大支流，蒙古国最长的河流。发源于杭爱山脉森林茂盛的山坡，流向东北，在接近国境处与色楞格河汇合，注入俄罗斯境内的贝加尔湖。全长1124千米，流域面积13.8万平方千米，支流众多。
克鲁伦河是呼伦湖（达赉湖）支流，因湖水通过以达兰鄂罗木河同额尔古纳河上源海拉尔河相联进入黑龙江，所以克鲁伦河属于黑龙江水系。发源于蒙古国的肯特山东麓。在中游乌兰恩格尔西端进入中国境内。流经呼伦贝尔盟新巴尔虎右旗，东流注入呼伦湖。全长1264公里，在中国境内206公里。成吉思汗所出的蒙古乞颜部以及塔塔儿部、弘吉剌部的原始驻牧地就在克鲁伦河流域，故它又有“蒙古人母亲河”之称。两岸为半荒漠的低山围绕，河谷宽约35公里，河宽70米。两岸沼泽湿地多，较高的阶地上生长着优良牧草，牧业发达。上游用于灌溉，流送木材，沿岸牧草丰富，自古为重要农牧业地带
