国库单一账户是指将所有的政府资金包括预算内资金和预算外资金集中于一家银行的账户，即财政部门在人民银行开设的国库存款账户，同时所有的财政支出包括预算内和预算外支出均能通过这一账户进行。取消各预算部门，预算单位及其他相关部门在商业银行开设的预算内资金账户和预算外资金账户。各部门、各单位发生的支出，直接从国库单一账户支付给个人或商品供应商及劳务提供者。
实行国库单一账户集中支付，虽然不改变各部、各单位的支出权限，但其作用在于建立起了预算执行的监督管理机制。一方面通过单一账户集中化管理，灵活地调度和使用资金，提高政府资金使用效率，降低成本另一方面从根本上杜绝在预算执行中的克扣、截留、挪用资金的现象，促进政策资金使用信息公开化、透明化，强化了约束力和社会监督力，从源头上堵住了政府资金使用的行政干预和腐败现象。
