在土壤生态系统中，位于土壤表面第一层为生物群体层，它是植物进行光合作用的主要场所，所占空间的高度依植物种类而异
土壤生态系统结构，是指土壤中生物的种类、数量和所占据的空间，以及非生物环境的构成及其相互依存的关系。它分为垂直结构和水平结构。垂直结构一般由三个层次构成：第一层为生物群体层，它是植物进行光合作用的主要场所，所占空间的高度依植物种类而异第二层是生物地被层，包括地面的生物群体及植物根系所在的土层。
其中土壤动物和土壤微生物丰富，是生物物质的累积、分解、转化，矿质元素的淋溶、淀积以及水分蒸发蒸腾的活跃场所第三层是土壤底层和岩石风化层，生物有机体少，是土壤矿质养分元素与水分补给的基地。水平结构一般有三种格局：均匀分布、簇生分布和随机分布。
此外
土壤发生学的最表面腐殖质层
耕作学的土壤最表面为耕耘层，一般20cm。
