佐世保港是日本军港兼商港。佐世保港地理位于经度：129.7151101，纬度33.1799153，九州西部松浦半岛，东南佐世保湾顶端，港市之西南，临东中国海。南距长崎港约40海里，东北距博多港128海里，西至中国上海港455海里。港口就分布在港湾北部。主要码头有：立伸码头，在湾顶，在坞式港池四周，计有9个泊位，水深均达10.6米，均可靠泊2万吨级船只，码头上配有6台15吨装卸机，其中1号和6－9号泊位为美海军专用码头，2－5号泊位为佐世保重工株式会社专用码头。
