要好一些的蛋白石是天然的硬化的二氧化硅胶凝体，含5-10%的水分。蛋白石与多数宝石不同，属于非晶质，蛋白石中有些不稳定的非晶质结构会因为水分缺失而变色甚至出现裂缝，但是也有一些结构非常稳定的蛋白石在正常环境中无变化。蛋白石在矿物学中属蛋白石类，包含变彩和不变彩的两种宝石，是一种含水的非晶质的二氧化硅。玻璃是由二氧化硅和其他化学物质熔融在一起形成的（主要生产原料为：纯碱、石灰石、石英）。在熔融时形成连续网络结构，冷却过程中粘度逐渐增大并硬化致使其结晶的硅酸盐类非金属材料。
