59～60集
上一次服部平次在外交官事件怀疑过柯南，但是没有继续追问，这一集服部平次非常确定柯南和新一是推理方式，以及柯南的思维能力，和工藤新一一模一样，然后每次沉睡毛利小五郎解决案件以后，他都会从小五郎后面出现。服部平次就彻底知道答案了。
服部平次在tv版第59-60集《福尔摩斯迷杀人事件》中知道柯南身份是工藤新一。在案件调查过程中，服部平次一直注意到柯南有远超过普通小学生的推理能力，一直对柯南有所怀疑。之后因为柯南麻醉服部平次后做推理，中途麻醉效果消失而被服部平次发现了。虽然柯南开始不承认自己是工藤新一，但是因为受到服部平次威胁说要告诉小兰，而不得不说出自己就是工藤新一的事实。
服部平次知道柯南的身份，是057福尔摩斯迷杀人事件(前篇)和058福尔摩斯迷杀人事件(后篇)。 在破案中服部就对柯南起疑心了，最后的时候柯南为了破案用麻醉枪把服部弄晕了，模仿服部的声音破案（其实服部醒了），案子结束时服部就揭穿了柯南的身份。
