食品生物技术的五大工程包括：基因工程、酶工程、发酵工程、细胞工程和蛋白工程。
食品生物工程是生物技术在食品原料生产、加工和制造中的应用的一个学科。它包括了食品发酵和酿造等最古老的生物技术加工过程，也包括了应用现代生物技术来改良食品原料的加工品质的基因、生产高质量的农产品、制造食品添加剂、植物和动物细胞的培养以及与食品加工和制造相关的其他生物技术。
食品生物技术涉及的五大工程是基因工程、酶工程、发酵工程、细胞工程和蛋白质工程。
这五大工程互相联系、相互渗透，构成了一个不可分割的整体。
作为生物技术核心内容的基因工程和细胞工程为发酵工程的菌种选育、酶工程与蛋白质工程中酶蛋白的改造等领域提供技术支持而发酵工程则为基因工程、细胞工程、酶工程和蛋白工程等领域的高科技成果实现产业化关键。
这五大工程基本原理和方法建立完整的生物技术结构体系和理论基础，介绍了现代生物技术手段和方法，它们在改善食品品质、提高食品产量和质量、开发食品新资源、以及对食品品质和安全进行有重要的作用和应用潜力。
