院使属于太医院最高长官，位列正五品官阶。清朝官制九品，每一品正、从两级。正五品官阶在其中属于中低级官员。从这里也可以看出，太医院在清朝衙门中，地位并不算高。左院判、右院判则为正六品官阶。这三个官职的地位，相当于太医院领导，当时一般称呼为“堂官”。它们地位虽高，但主要办事人员仍是御医为主。毕竟御医数量更多。
