大学校长由哪个部门认定

应该由当地省教育厅人事科认定，需要经过当地省教育厅厅委员会通过，特别是教育厅厅长认可，由人事科部门认定并且办理手续。

如果是国家普通大学的校长，需要经过国家教委人事司认定，如果是国家重点大学的校长，应该是国务院直接认命。