事业单位副科级辞职首先要提交本人辞职申请书，经单位党委会通过后拿给组织人事部门审批，县委常委会通过后下文就可以正式辞职了。
按照《事业单位人事管理条例》规定，事业单位在岗职工辞职，是由人事主管部门审批，并不一定是由单位审批。辞职的程序，先由个人向单位提出辞职，说明辞职原因，填写相关表格，由单位同意后交业务主管部门审核，再由人事主管部门审批同意。例如县区中小学校教师辞职，先要向所在学校提出辞职，并填写《辞职审批表》，由单位同意后交教育局签署审核意见，再报人社局研究，同意后告知本人，并发文或正式信函确认，个人才能依此办理出编手续和社保、人事档案转接手续。如果不见正式文件或者信函，编办、社保、人事档案管理等部门，是不能擅自办理相关手续的，因为一般干部的人事管理权在人社局。
当然如果是副科级以上干部，则由组织部办理。
