1、硝化菌要依附在某种物质上，因此首先要为硝化菌准备附着物，一般表面积大、疏松、多孔的材料最合适，如生物球、陶瓷环等，沙石也可作为附着物。2、然后将硝化菌倒在过滤装置里。现在很多水族箱都是采用上滤的方式，把硝化菌倒在过滤盒、过滤桶里也可以。过滤盒里是专用的水族棉，也是可以给硝化菌依附的。生化过滤有生化棉，陶瓷环，细菌环，麦饭石，火山岩，珊瑚石等，主要是培养硝化菌，吸附有害化学物质，硝化菌可以稳定水质，分解鱼便，保持水长期清澈。以上过滤材料均可代替活性炭，混合使用效果更佳。
