中亚地处亚欧大陆中部，距海较远。（与中国相邻的有哈萨克斯坦、吉尔吉斯斯坦、塔吉克斯坦和阿富汗斯坦），河流包括多为内流河（阿姆河、锡尔河等），外流河有额尔齐斯河。湖泊包括多为内流湖，西部濒临世界最大的内流湖——里海，中部有咸海，巴尔喀什湖，阿拉湖，伊塞克湖。
咸海作为自然地理的中亚来说，它的所有河流都没有通向大洋的出口，河水除了被引走用于灌溉外，或者消失于荒漠，或者注入于内陆湖泊。
锡尔河是流经中亚的最长的河流，全长3019公里（含上游纳伦河），发源于天山山区西部。它所灌溉的费尔干纳和塔什干绿洲，是中亚最重要的经济区。
阿姆河全长2394公里（含上游喷赤河），是中亚水量最充沛的大河，发源于帕米尔山区，落差大，拥有丰富的水电资源，其上游建成最大的努列克水电站，装机容量达270万千瓦。
咸海，锡尔河、阿姆河这两条大河最终注入中亚最大的湖泊──咸海。咸海面积约6.4万平方公里，按面积来说，它是世界第四大湖，但由于过度滥用这两条大河的河水，咸海的水位已急剧下降，悲观者认为它将因水源枯竭而迅速消失，由此产生咸海生态危机。
泽拉夫尚河位于阿姆河与锡尔河之间，发源于阿赖山。它哺育着中亚腹地美丽的绿洲──撒马尔罕绿洲和布哈拉绿洲，没于克孜尔库姆沙漠。
卡拉铁詹河位于阿姆河左方的一条河 ，发源于伊朗、阿富汗高原，滋润着土库曼斯坦的阿什哈巴德绿洲和马雷绿洲。
穆尔加布河长850公里长、流域面积6万平方公里、平均流量约每秒50立方米，集水面积约47000平方公里，其中约八成是在阿富汗斯坦国境之内。
塔拉斯河和楚河发源于吉尔吉斯斯坦天山山区的。
伊塞克湖为高山深水湖，已知最大深度为702米，在欧亚大陆的所有湖泊中仅次于贝加尔湖。伊塞克湖以其巨大的容水量影响着湖区的气候，它虽然高踞海拔1600米，但即使在隆冬也不结冻，因此又以“热海”闻名于世。
伊犁河发源于中国新疆天山深处，全长1439公里，在哈萨克斯坦境内802公里，注入巴尔喀什湖。
巴尔喀什湖面积2.2万平方公里，西半部淡水，东半部咸水，其间仅有极窄的水道相通连。流入巴尔喀什湖的至少有七条较大的河流，因此这一地区又被称作谢米列契（七河）地区。
乌拉尔河发源于俄罗斯联邦的南乌拉尔山，在哈萨克斯坦境内长1084公里，注入里海。
额尔齐斯河在北哈萨克斯坦，发源于中国阿勒泰山区，携带其支流伊希姆河、托博尔河汇入俄罗斯联邦的鄂毕河而最终注入北冰洋。额尔齐斯河长4248公里，在哈萨克斯坦境内1400公里。
