公司只交三险自己能交新农合吗

不可以。

三险不可能没有医疗保险。我们俗称的三险是指社会保险也就是单位为员工缴纳的社会保险。现在都是五险合一，包括医疗保险，养老保险，失业保险，工伤保险和生育保险。即使没有五险之前只缴纳三险，也肯定有医疗保险。以前的三险是指医疗保险，养老保险和工伤保险。