可杀死土壤里的部分有益菌。土壤含有大量微生物，包括真菌、细菌、病毒等。微生物又有益和有害之分。多菌灵对细菌、病毒无效，只对真菌有效。多菌灵能杀死土壤中的所有真菌，不论有害菌和有益菌。所以，多菌灵要规范使用，浓度不宜过大，喷施量不宜太多。
