1、 秦时明月之百步飞剑
第一部主要是在讲盖聂带着故人荆轲的儿子子天明躲避秦王追杀的故事。李斯用盖聂作为诱饵引诱刺客团的首领卫庄出山，甚至还企图用“以江湖对江湖”的策略。而这边，盖聂和天明在逃亡的路上，认识了少女高月，还有楚国的大将之后项少羽和墨家的高手，一行人最后一起进入了世上最后一片净土——墨家机关城。
2、秦时明月之夜尽
第二部讲了他们在进入机关城之后，机关城集结墨家的智慧，而隐藏在于悬崖峭壁之间。而秦王这边呢，自从得知他们进城之后，就派出庞大的精锐之师跟随卫庄去攻城，因为公输家族掌门人公输仇也加入了卫庄的阵营，所以机关城遭受到前所未有的挑战。
3、秦时明月之诸子百家
第三部讲的是乱世还没有结束，一股强大的力量正在为对付大秦而开始崛起，在咱们的历史上都把它称之为诸子百家。到现在，天下反秦势力的最后一个堡垒——墨家机关城。
4、秦时明月之万里长城
第四部讲的是墨家机关城在被秦他们攻打的时候开始出现崩塌，而墨家的势力几乎全部被秦清除掉。所以秦的帝国好像又回到太平盛世的迷梦中。而秦在一边开始动用无数的劳工修造万里长城，一边又开始进行着更为精密的计划。
5、秦时明月之君临天下
第五步讲的是为躲避公输家族霸道机关兽的追杀，天明、少羽、石兰三人误打误撞，登上了停泊在海边的蜃楼。这艘始终停留在远处，可望而不可即的神秘巨舰，终于第一次近距离展现在三人面前，它华丽的外表之下，隐藏着天大的秘密。为躲开蜃楼上阴阳家弟子的追捕，三人逐渐深入到这座谜城一般的巨舰内部，开始了奇幻莫测的探险逃亡之旅。
6、 秦时明月之龙腾万里
第六步讲的是少年天明、少羽在机缘巧合之下一起卷入了秦始皇夺取远古龙魂的秘密行动中，传说中的仙境即将再次陷入千年未遇的劫难。来自茫茫沙海的陌生少女，美丽而又神秘，和她的相遇仿佛是命运的指引，跨越千年的时空，冥冥之中早已注定。秦军战旗环伺之下，来自上古的可怕力量正在苏醒！面对这场浩劫，他们能否成功扭转乾坤，拯救天下苍生。
