纯种柯基的眼睛颜色呈黑褐色，眼睛四周的颜色也是以黑色为主，看起来就像没睡好留下的黑眼圈，眼睛形状一般为椭圆形的，眼睛的颜色与身上的毛色一般看起来很协调。若是出现异瞳，有两个原因。第一，柯基异瞳是遗传症，不会影响柯基成长，但不建议交配繁育。第二，是因为后天眼膜损伤，导致引起虹膜异色症，需要及时建议检查，在治疗成功且身体健康基础下，可进行生育。狗只能看到黄、蓝、灰色，而红色对狗狗来说是暗色，绿色在狗狗眼里是白色，所以狗狗看到的世界是冷色调的，只是有颜色亮暗区分。
