通过对比大小来分辨，因为巨人蜈蚣比普通蜈蚣大很多。蜈蚣惧畏日光，昼伏夜出，喜欢在阴暗、温暖、避雨、空气流通的地方生活。蜈蚣喜欢生活在丘陵地带和多沙土地区，白天多潜伏在砖石缝隙、墙脚边和成堆的树叶、杂草、腐木阴暗角落里，夜间出来活动。
分辨的方法主要是体型大小不同、毒液成分不同、食性不同。
普通蜈蚣：因分布于亚热带或温带地区，相较热带蜈蚣体型略小，是我国最常见的大型蜈蚣之一，因红色红色或金色的头部而得名。它骇人的大毒颚是捕食的得力工具。猎物一旦被盯上，就很难逃脱它精、准、狠的攻击。
北美巨人蜈蚣：北美洲体型最大的蜈蚣，具有相当高的观赏性。性情十分凶恶，喜欢主动捕食栖息地范围内的各种动物。它能够昂起头，用大颚抓住飞行昆虫，并用毒液制服猎物。
巨人蜈蚣和普通蜈蚣靠颜色分辨。
而一般药用蜈蚣头为鲜红色，身体黑色，颜色比较深，脚黄色(其实一般就是红头蜈蚣)，也比较小，可以群居，除了脚为黄色，身体大多为暗红色，总之颜色对比比较明显，当然越南巨人蜈蚣体形健硕
