1、领域不同。贸易保护主义是商业领域的自我保护政策，单边主义是政治与外交领域的行为。
2、手段不同。贸易保护主义的主要手段是关税、进口配额与减少进口，单边主义把谋取一己私利建立在损害别国正当利益之上。
2、目的不同。贸易保护主义是为了保护本国产业，单边主义是为了落实对本国有利的外交政策与丑化他国。
贸易保护主义主要是为了保护国内市场以促进国内生产力的发展。这与早期的重商主义的保护贸易目的很不相同。重商主义限制进口，鼓励出口，其目的是为了积累金银财富主张的保护贸易的目的则是为了提高创造财富的生产力。
表现方式主要有：出口补贴，进口关税和进口配额。 国家广泛利用各种限制进口的措施，保护本国市场免受外国商品的竞争，并对本国商品给予优待和补贴，以鼓励出口。
世贸组织改革必须坚持反对保护主义和单边主义的方向，必须有助于推进世界范围的贸易自由化、投资便利化进程，必须坚持非歧视的原则，必须充分发扬民主。
