孙子与爷爷基因相似度是25%。因为父亲继承了他爸爸的50%的血缘和基因。孙子又继承了他父辈50%的血缘和基因。这样算来孙子与爷爷基因相似度是1/4。基因相似度为25%。一个人的遗传基因和血缘关系分别来自父母的各50%，那么爸爸应该有爷爷和奶奶的相似基因各50%。孙子是儿子的儿子，爷爷是爸爸的爸爸。因为爸爸和爷爷有50%的遗传基因，所以孙子和爷爷有50%的1/2遗传基因，计基因相似度为25%。
