1、劳动关系的不同
事业编是与第三方签订的劳动合同，与实际用人单位并不存在劳动关系。而直签则是与用人单位直接签订的劳动合同，你也便是用人单位的正式员工，与用人单位间是存在劳动关系的。
2、待遇的不同
在没有实行同酬同工时的工待遇要比正式工少了很多，而在实行了劳务同工同酬后，两者间的待遇虽几乎相
1、工资开支来源不同
正式编制人员工资由财政拨款解决
合同制人员工资由单位预算外收入中解决
2、福利待遇不同
正式编制人员的福利待遇按政策规定及上级部门规定执行
合同制人员参照正式编人员标准执行，但实际上低很多或缺项
3、提任和调动不同
正式编人员可以在事业单位之间调动，可以提任副科级职务
合同制人员不可以在事业单位之间调动或提任副科级职务
工作人员列入事业编制的单位，其工作人员的工资和活动经费的开支渠道除一般由国家事业费开支的外，还有部分事业单位的经费，采取自收自支，差额补贴等办法。
事业编制的是正式工，合同制没有编制，而且工资也差多了，可以根据合同解除聘用关系。 事业单位工作的工人身份的人员只要有事业编制就是正式工，按照工人工资档次发放工资，其余按照管理类别和专业技术类别发放工资。
事业编是国家统一拨款，且待遇是合同人员的3倍左右，直签合同工通常是用人单位内部经费解决，通常待遇要低很多，这就是相当于以前所说的临时工。
