区别如下：
1.性质不同叠墅一般为四层带阁楼建筑，由多层的复式住宅上下叠加在一起组合而成，下层有花园，上层有屋顶花园，具有独门独院、独立扶梯、超大露台、私家庭院、多重花园等设施。复式的房型是客厅或餐厅位置上下两层连通，其他位置上下两层区分，有内部楼梯。
2.产生方式不同叠墅是在综合情景洋房公寓与联排别墅特点的基础上产生的，复式是起源于跃层，又优于跃层的基础上产生的。
叠层房屋是由多层的复式住宅上下叠加在一起组合而成的，下层有花园，上层有屋顶花园，一般是四层，有阁楼。而复式房屋一般是大面积的顶楼住宅，有楼下与楼下，楼梯在里面，层高基本都是一样的，普遍都设有大露台，这里要注意的是楼上两米以上是按实际面积进行计算的。
