建州都督是明朝政府对女真部落首领所任命的官职名称，应该说这个官职是一个虚职，这样的官职封给了好多女真部落首领。
而辽东总兵是明朝政府在辽东的最高军事长官，监视，统辖建州都督是其职业之一。
以李成梁为例，在他担任辽东总兵时，多次杀掉不接受明朝约束的建州都督。
建州都督和辽东总兵有啥区别
清朝时有一支来自北方游牧民族建立起来的王朝，在此之前他们所在的部落是女真部落，在女真各部之间也是相互争斗，逐渐演变成了不死不休的局面。
而这些部落中有一支人马的领导姓爱新觉罗父子两个一个叫觉昌安，一个叫塔克世。由于他们当时对明朝有功，因此封他们为建州左都尉指挥使是二品的都督。
名义上由建州负责整个女真部落的管理，但这也只是象征性的管理。
真正大权在握的是朝廷在辽东设立的辽东总兵府，为了防止各部谋反所设立的监管机构，朝廷为此还在此地陈兵十万，虽然建州都督的品级比总兵要高，但大权还是在李成梁这个三品总兵的手里。
