1、大小不同。中子质量为 1.6749286 ×10-27千克，比质子的质量稍大质子的质量为1.672621637（83）×10-27千克。
2、带电情况不同。中子不带电，而一般质子带一个电荷正电荷（+ 1.60217733 × 10-19库仑）。
3、稳定性不同。单独存在的中子是不稳定的，平均寿命约为16分钟，而质子是一种稳定的、不衰变的粒子，寿命大于10的35次方年。
4、应用范围不同。中子可以产生中子核反应，可以制备中子弹核武器而质子常被用来在加速器中加速到近光速后用来与其它粒子碰撞，慢速的质子也可能被原子核吸收用来制造人造同位素或人造元素。比如核磁共振技术应用等。
原子由原子核和核外电子组成，原子核由质子和中子组成。质子带正电，中子不带电。因此，原子核带正电。核外电子带负电，正常情况下，核外电子总共所带负电跟原子核所带正电数量相等，原子成电中性。
