主要区别。第一，科属不同，剑鱼是剑鱼科剑鱼属动物而旗鱼是旗鱼科旗鱼属动物。第二，体形大小不同，剑鱼平均重量为68-113千克，平均长度2.1米，嘴占其身长的1/3。箭鱼、剑鱼而旗鱼最大的旗鱼可长达数米，重达上百千克，是海洋中游速最快的鱼类之一。
剑鱼是世界上热带、亚热带海洋中一种常见鱼类，因其上颌向前延伸呈剑状而得名。剑鱼拥有典型的流线型身体，体表光滑，上颌长而尖，背部的鳍较小，嘴较扁平，无腮和腹鳍。剑鱼颜色各异，大体上鱼背和鱼身为棕偏黑色。
1、背鳍区别：
旗鱼的背鳍十分发达，从外观上来看是帆状的，这也是它们得名的原因。它们的背鳍一直从头部延伸到它们的尾巴，体积非常大。
而剑鱼的背鳍则比较小，并不是特别明显，一般是三角状的。
2、颜色区别：
旗鱼的身体颜色更多样一样，有些品种甚至由两种比较鲜艳的颜色组成，是呈渐变分布的。它们也会有一些鲜艳的颜色，比如红色、紫色、黄色等。
剑鱼的颜色也一般是背部比较暗、腹部则稍微浅一些。
