水资源管理是水行政主管部门运用行政、法律、经济、技术和教育等手段，组织各种社会力量开发水利和防治水害，协调社会经济发展与水资源开发利用之间的关系，处理各地区、各部门之间的用水矛盾，监督、限制不合理的开发和危害水源的行为，制定供水系统和水库工程的优化调度方案。水资源管理的三大制度，一是国家水权分配制度，二是排污总量控制制度，三是洪水风险管理制度。水利三大管理制度的建立，通过管理体制的改革不断提升水利社会管理水平，促进水资源的可持续利用。
